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基因组：以生物体所有的核酸为研究对象，狭义的基因组定义为生命体的全套DNA，广义的基因组则包含DNA、mRNA、lncRNA等参与到基因表达调控的所有核酸序列 。其主要研究手段为基因测序，以华大基因为代表 。转录组通常可认为是基因组的简化研究手段，即所有转录本的集合 。
蛋白组：生物体基因组所编码的全套蛋白质 。鉴于蛋白质表达的时空特异性，各组织器官或者特定亚细胞结构器（如线粒体、叶绿体），甚至是外泌蛋白，也可以成为一个蛋白组 。所以蛋白质组是信号转导、分子发育最为直接的手段 。其主要研究手段为生物质谱，在国内以牟合蛋白为典型 。
【基因组和蛋白质组的区别】
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